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31 de enero de 2025
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Novel PiuC, PirA, and PiuA mutations leading to in vivo cefiderocol resistance progression in IMP-16- and KPC-2-producing Pseudomonas aeruginosa from a leukemic patient.

Publicado en: Microbiology Spectrum. 13 (3): e0192824- - 2025-01-28 13(3), DOI: 10.1128/spectrum.01928-24

Autores:

Viñes J; Herrera S; Vergara A; Roca I; Vila J; Aiello TF; Martínez JA; del Río A; Lopera C; Garcia-Vidal C; Casals-Pascual C; Soriano À; Pitart C
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Afiliaciones

Departament de Malalties Infeccioses, Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain. - Autor o Coautor
Servei de Microbiologia i Parasitologia-CDB, Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain. - Autor o Coautor

Resumen

Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen capable of causing severe infections in immunocompromised individuals, who often require prolonged antibiotic therapy. The emergence of carbapenemase-producing P. aeruginosa has further complicated the management of nosocomial infections, limiting therapeutic options. Cefiderocol has recently emerged as a promising antipseudomonal agent, using the bacterial iron transport system to gain entry into the cell; however, there have been reports of P. aeruginosa resistant to cefiderocol. We describe the in vivo cefiderocol resistance progression of four consecutive P. aeruginosa isolates from one patient with T-cell acute lymphoblastic leukemia. Analysis of potential genes involved in cefiderocol transport resulted in three genes mutated in two resistant isolates. One isolate presented a S116F substitution in PiuC, and the other presented a deletion of 29 amino acids in the signal peptide of PiuA and a STOP substitution in PirA, resulting in the deletion of a piece of the channel. These mutations increased 24- and 64-folds the cefiderocol minimum inhibitory concentration, respectively. The mutations in the aforementioned genes may directly impact siderophore internalization, thereby contributing to an elevation in the MIC of the antibiotic. Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa poses a significant challenge due to its broad antibiotic resistance. Cefiderocol is a novel antibiotic aimed at combating infections caused by such organisms. However, if these pathogens develop resistance to this new drug, it hinders treatment efficacy and options. Therefore, it is crucial to identify and describe mutations in the genes involved in the uptake of cefiderocol to find better treatment strategies for patients infected with multidrug-resistant P. aeruginosa.
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Palabras clave

Anti-bacterial agentsAntiinfective agentAvibactam plus ceftazidimeAztreonamBacterial proteinBacterial proteinsBeta lactamaseBeta-lactamasesCarbapenem-resistantCarbapenemase 2CefiderocolCephalosporinsCyclophosphamideCytarabineDexamethasoneDoxorubicinDrug effectDrug resistance, multiple, bacterialDrug therapyGeneticsHumansHypertensive factorImipenemase 16In vivo studyInduction chemotherapyInotuzumab ozogamicinInternalization (cell)Invasive ventilationIsavuconazoleLeukemiaLevofloxacinLung consolidationMaleMatrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometryMercaptopurineMetabolismMicrobial sensitivity testMicrobial sensitivity testsMicrobiologyMinimal residual diseaseMinimum inhibitory concentrationMitoxantroneMultidrug resistanceMultidrug resistant pseudomonas aeruginosaMutationNanopore sequencingNeutropenic enterocolitisNonhumanNonsense mutationNorovirus infectionNuclear magnetic resonance imagingNucleotide sequenceOxford nanoporePiperacillin plus tazobactamPiraPira proteinPiuaPiua proteinPiucPiuc proteinPseudomonas aeruginosaPseudomonas infectionPseudomonas infectionsQuality controlRectal swabRespiratory tract diseaseRituximabSecond-line treatmentSeptic shockSiderophoreStenotrophomonas maltophiliaSwabbingT cell acute lymphoblastic leukemiaTeicoplaninThorax radiographyTomographyUnclassified drugUrine samplingVincristineWound swab

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Microbiology Spectrum debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2025, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Ecology.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-16:

  • Scopus: 9
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-16:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 10.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 10 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 1.

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Viñes J) y Último Autor (Pitart C).

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